Biodiesel has received much attention in recent years. Although numerous reports are available on the production of biodiesel from vegetable oils of terraneous oil-plants, such as soybean, sunflower and palm oils, the production of biodiesel from microalgae is a newly emerging field. Microalgal biotechnology appears to possess high potential for biodiesel production because a significant increase in lipid content of microalgae is now possible through heterotrophic cultivation and genetic engineering approaches. This paper provides an overview of the technologies in the production of biodiesel from microalgae, including the various modes of cultivation for the production of oil-rich microalgal biomass, as well as the subsequent downstream processing for biodiesel production. The advances and prospects of using microalgal biotechnology for biodiesel production are discussed.

The principal pathological features of Alzheimer's disease (AD) are extracellular amyloid plaques and intracellular neurofibrillary tangles, the latter composed of the microtubule-binding protein tau assembled into paired helical and straight filaments. Recent studies suggest that these pathological entities may be functionally linked, although the mechanisms by which amyloid deposition promotes pathological tau filament assembly are poorly understood. Here, we report that tau is proteolyzed by multiple caspases at a highly conserved aspartate residue (Asp 421 ) in its C terminus in vitro and in neurons treated with amyloid-β (Aβ) (1–42) peptide. Tau is rapidly cleaved at Asp 421 in Aβ-treated neurons (within 2 h), and its proteolysis appears to precede the nuclear events of apoptosis. We also demonstrate that caspase cleavage of tau generates a truncated protein that lacks its C-terminal 20 amino acids and assembles more rapidly and more extensively into tau filaments in vitro than wild-type tau. Using a monoclonal antibody that specifically recognizes tau truncated at Asp 421 , we show that tau is proteolytically cleaved at this site in the fibrillar pathologies of AD brain. Taken together, our results suggest a novel mechanism linking amyloid deposition and neurofibrillary tangles in AD: Aβ peptides promote pathological tau filament assembly in neurons by triggering caspase cleavage of tau and generating a proteolytic product with enhanced polymerization kinetics.

In order to identify new sources of safe and inexpensive antioxidants, the antioxidant capacity and total phenolic content of different fractions of 23 microalgae were evaluated, using Trolox equivalent antioxidant capacity assay and the Folin–Ciocalteu method, respectively. The microalgae were extracted using hexane, ethyl acetate and water by a three-step sequential extraction procedure. Most of these microalgae were evaluated for the first time for their antioxidant activities. It was found that the microalgae Synechococcus sp. FACHB 283, Chlamydomonas nivalis and Nostoc ellipsosporum CCAP 1453/17 possessed the highest antioxidant capacities and thus could be potential rich sources of natural antioxidants. In addition, the correlation coefficients between the antioxidant capacities and the phenolic contents were very small in hexane (R2 = 0.0075), ethyl acetate (R2 = 0.5851) and water (R2 = 0.3599) fractions. Thus, phenolic compounds were not a major contributor to the antioxidant capacities of these microalgae. This was very different from many other plant species like fruits, vegetables and medicinal plants. The microalgae could contain different antioxidant compounds from other plants.

Abstract Pyrosequencing of 16S rRNA gene amplicons for microbial community profiling can, for equivalent costs, yield more than two orders of magnitude more sensitivity than traditional PCR cloning and Sanger sequencing. With this increased sensitivity and the ability to analyze multiple samples in parallel, it has become possible to evaluate several technical aspects of PCR-based community structure profiling methods. We tested the effect of amplicon length and primer pair on estimates of species richness (number of species) and evenness (relative abundance of species) by assessing the potentially tractable microbial community residing in the termite hindgut. Two regions of the 16S rRNA gene were sequenced from one of two common priming sites, spanning the V1–V2 or V8 regions, using amplicons ranging in length from 352 to 1443 bp. Our results show that both amplicon length and primer pair markedly influence estimates of richness and evenness. However, estimates of species evenness are consistent among different primer pairs targeting the same region. These results highlight the importance of experimental methodology when comparing diversity estimates across communities.

The antioxidant activities and total phenolic contents of 30 Chinese medicinal plants were evaluated using the ferric reducing antioxidant power assay and the Folin–Ciocalteu method, respectively. The Chinese medicinal plants were extracted by the traditional method, boiling in water and also in 80% methanol. A significant and linear correlation coefficient between the antioxidant activity and the total phenolic content was found in both aqueous (R2 = 0.7917) and methanol (R2 = 0.7584) extracts. Phenolic compounds are thus a major contributor of antioxidant activity. Comparing the extraction efficiency of the two methods, the boiling water method extracted phenolic compounds more efficiently, and antioxidant activity of the extract was higher. It was found that the Chinese medicinal plants Rhodiola sacra Fu, the stem of Polygonum multiflorum Thunb. and the root of P. multiflorum Thunb. possessed the highest antioxidant activities and thus could be potential rich sources of natural antioxidants.

In order to find out new sources of safe and inexpensive antioxidants, the antioxidant capacities of 45 selected medicinal plants were evaluated using ferric reducing antioxidant power (FRAP) and Trolox equivalent antioxidant capacity (TEAC) assays, respectively, and the total phenolic contents of these plants were measured by the Folin–Ciocalteu method. Most of these plants were analyzed for the first time for their antioxidant activities. It was found that the plants Sargentodoxa cuneata Rehd. Et Wils, Fraxinus rhynchophylla Hance, Paeonia lactiflora Pall, Paeonia suffruticosa Andr and Scutellaria baicalensis Ceorgi possessed the highest antioxidant capacities and thus could be potential rich sources of natural antioxidants. A strong correlation between TEAC values and those obtained from FRAP assay implied that antioxidants in these plants were capable of scavenging free radicals and reducing oxidants. A high correlation between antioxidant capacities and their total phenolic contents indicated that phenolic compounds were a major contributor of antioxidant activity of these plants.

Effective antiviral agents are urgently needed to combat the possible return of severe acute respiratory syndrome (SARS). Commercial antiviral agents and pure chemical compounds extracted from traditional Chinese medicinal herbs were screened against 10 clinical isolates of SARS coronavirus by neutralisation tests with confirmation by plaque reduction assays. Interferon-beta-1a, leukocytic interferon-alpha, ribavirin, lopinavir, rimantadine, baicalin and glycyrrhizin showed antiviral activity. The two interferons were only active if the cell lines were pre-incubated with the drugs 16 h before viral inoculation. Results were confirmed by plaque reduction assays. Antiviral activity varied with the use of different cell lines. Checkerboard assays for synergy were performed showing combinations of interferon beta-1a or leukocytic interferon-alpha with ribavirin are synergistic. Since the clinical and toxicity profiles of these agents are well known, they should be considered either singly or in combination for prophylaxis or treatment of SARS in randomised placebo controlled trials in future epidemics.

Sequencing of 16S rRNA gene tags is a popular method for profiling and comparing microbial communities. The protocols and methods used, however, vary considerably with regard to amplification primers, sequencing primers, sequencing technologies; as well as quality filtering and clustering. How results are affected by these choices, and whether data produced with different protocols can be meaningfully compared, is often unknown. Here we compare results obtained using three different amplification primer sets (targeting V4, V6-V8, and V7-V8) and two sequencing technologies (454 pyrosequencing and Illumina MiSeq) using DNA from a mock community containing a known number of species as well as complex environmental samples whose PCR-independent profiles were estimated using shotgun sequencing. We find that paired-end MiSeq reads produce higher quality data and enabled the use of more aggressive quality control parameters over 454, resulting in a higher retention rate of high quality reads for downstream data analysis. While primer choice considerably influences quantitative abundance estimations, sequencing platform has relatively minor effects when matched primers are used. Beta diversity metrics are surprisingly robust to both primer and sequencing platform biases.

N6-Methyladenosine (m6A) modification has been implicated in the progression of several cancers. We reveal that during epithelial-mesenchymal transition (EMT), one important step for cancer cell metastasis, m6A modification of mRNAs increases in cancer cells. Deletion of methyltransferase-like 3 (METTL3) down-regulates m6A, impairs the migration, invasion and EMT of cancer cells both in vitro and in vivo. m6A-sequencing and functional studies confirm that Snail, a key transcription factor of EMT, is involved in m6A-regulated EMT. m6A in Snail CDS, but not 3'UTR, triggers polysome-mediated translation of Snail mRNA in cancer cells. Loss and gain functional studies confirm that YTHDF1 mediates m6A-increased translation of Snail mRNA. Moreover, the upregulation of METTL3 and YTHDF1 act as adverse prognosis factors for overall survival (OS) rate of liver cancer patients. Our study highlights the critical roles of m6A on regulation of EMT in cancer cells and translation of Snail during this process.

The objective of this study was to document and compare the lipid class and fatty acid composition of the green microalga Chlorella zofingiensis cultivated under photoautotrophic and heterotrophic conditions. Compared with photoautotrophic cells, a 900% increase in lipid yield was achieved in heterotrophic cells fed with 30 g L(-1) of glucose. Furthermore heterotrophic cells accumulated predominantly neutral lipids (NL) that accounted for 79.5% of total lipids with 88.7% being triacylglycerol (TAG); whereas photoautotrophic cells contained mainly the membrane lipids glycolipids (GL) and phospholipids (PL). Together with the much higher content of oleic acid (C18:1) (35.2% of total fatty acids), oils from heterotrophic C. zofingiensis appear to be more feasible for biodiesel production. Our study highlights the possibility of using heterotrophic algae for producing high quality biodiesel.