WY
Wen‐Dong Yao
Author with expertise in Mantle Dynamics and Earth's Structure
Achievements
This user has not unlocked any achievements yet.
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
6
(0% Open Access)
Cited by:
6
h-index:
27
/
i10-index:
66
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Membrane-fused and mannose-targeted vesicles as immunoenhanced biomimetic nanovaccines for prevention and therapeutics of melanoma

Tengfei Liu et al.Jun 3, 2024
Melanoma is a tumor sensitive to immune response and its immunotherapy has been a research hotspot in recent years. By fusion of melanoma cell membranes and bacterial exosomes through sequential extrusion, we herein design a three-in-one multi-antigenic nanovaccine, namely TBM, to rapidly target immune system. TBM can induce RAW264.7 macrophage cells to differentiate into M1 type cells to release cytotoxic cytokines. It can also promote the maturation and antigen presentation of bone marrow-derived dendritic cells, thus activating spleen T cells to kill B16F10 melanoma cells in vitro. TBM can significantly inhibit the growth and metastasis of melanoma in vivo, and prolong the lifetime of mice, suggesting the preventive effects of vaccines. Further, we integrate cell membranes from mouse melanoma tissues into a novel personalized therapeutic vaccine, namely autologous TBM (ATBM). ATBM combined with Anti PD1 can activate anti-tumor immune response and increase the survival rate of melanoma allografted mice, as supported by eukaryotic reference mRNA-Seq transcriptome sequencing. Generally, this study demonstrates the preventive and therapeutic effects of biomimetic nanovaccines against melanoma, which may be extended to design personalized tumor vaccines for all tumors with immunogenicity, showing great clinical perspectives.
0
Citation2
0
Save
0

An Improved Framework for Drug-side effect Associations Prediction via Counterfactual Inference-based Data Augmentation

Wen‐Dong Yao et al.Jan 1, 2024
Detecting side effects of drugs is a fundamental task in drug development. With the expansion of publicly available biomedical data, researchers have proposed many computational methods for predicting drug-side effect associations (DSAs), among which network-based methods attract wide attention in the biomedical field. However, the problem of data scarcity poses a great challenge for existing DSAs prediction models. Although several data augmentation methods have been proposed to address this issue, most of existing methods employ a random way to manipulate the original networks, which ignores the causality of existence of DSAs, leading to the poor performance on the task of DSAs prediction. In this paper, we propose a counterfactual inference-based data augmentation method for improving the performance of the task. First, we construct a heterogeneous information network (HIN) by integrating multiple biomedical data. Based on the community detection on the HIN, a counterfactual inference-based method is designed to derive augmented links, and an augmented HIN is obtained accordingly. Then, a meta-path-based graph neural network is applied to learn high-quality representations of drugs and side effects, on which the predicted DSAs are obtained. Finally, comprehensive experiments are conducted, and the results demonstrate the effectiveness of the proposed counterfactual inference-based data augmentation for the task of DSAs prediction.