Maize is one of the most important crops globally, and it shows remarkable genetic diversity. Knowledge of this diversity could help in crop improvement; however, gold-standard genomes have been elucidated only for modern temperate varieties. Here, we present a high-quality reference genome (contig N50 of 15.78 megabases) of the maize small-kernel inbred line, which is derived from a tropical landrace. Using haplotype maps derived from B73, Mo17 and SK, we identified 80,614 polymorphic structural variants across 521 diverse lines. Approximately 22% of these variants could not be detected by traditional single-nucleotide-polymorphism-based approaches, and some of them could affect gene expression and trait performance. To illustrate the utility of the diverse SK line, we used it to perform map-based cloning of a major effect quantitative trait locus controlling kernel weight—a key trait selected during maize improvement. The underlying candidate gene ZmBARELY ANY MERISTEM1d provides a target for increasing crop yields. A high-quality reference genome of the maize SK inbred line and analyses between the tropical SK line and two other maize genomes, B73 and Mo17, provide insights into structural variation and crop improvement.

TPS3191 Background: PARP inhibitors (PARPi) selectively kill tumor cells harboring genetic mutations in critical DNA repair genes (e.g., BRCA1/2). While several approved nonselective PARPi have provided robust anti-tumor activity, they are associated with significant hematologic toxicities that limit dose intensity and clinical benefit. Drugs that selectively inhibit PARP1 but spare PARP2 may improve the risk-benefit profile for this class of therapies by retaining anti-tumor activity while avoiding PARP2-related toxicities. IMP1734 (EIK1003) is a potent PARP1-selective inhibitor that inhibits tumor growth in nonclinical models and may widen the therapeutic index in tumors where non-selective PARPi have demonstrated efficacy. Methods: Study EIK1003-001 (IMP1734-101) is a global, multi-center, Phase 1/2 study evaluating the safety and potential antitumor activity of IMP1734 in participants with advanced solid tumors. The study has 3 parts: Part 1 (FIH; Dose Escalation), Part 2 (Dose Optimization), and Part 3 (Dose Expansion at the recommended dose for expansion [RDE]). Part 1 of this study is currently enrolling and consists of dose escalation of IMP1734 in study participants with advanced/recurrent/metastatic ovarian, breast, or prostate cancer with suspected deleterious/deleterious mutations in a pre-specified panel of homologous recombination repair (HRR) genes (n = 70). Eligible participants must be ≥ 18 years of age, have histologically or cytologically confirmed tumors as indicated in each study part, and at least 1 RECIST v1.1-measurable lesion and/or pre-specified serum tumor-specific marker. All participants must have a deleterious or suspected deleterious mutation in select HRR genes. Primary endpoints include safety and tolerability (evaluation of dose-limiting toxicities and determining the maximum tolerated dose, maximum achievable dose, and RDE). Secondary endpoints include evaluation of the pharmacokinetic parameters of IMP1734 and measures of efficacy, including overall response rate, duration of response, progression-free survival, and overall survival. Exploratory endpoints include analysis of pharmacodynamic biomarkers, serial ctDNA measurements, and patient quality-of-life measures. This study opened on 11 Dec 2023. Clinical trial information: NCT06253130 .

Background: Intestinal inflammation and compromised barrier function are critical factors in the pathogenesis of gastrointestinal disorders. This study aimed to investigate the role of miR-192-5p in modulating intestinal epithelial barrier (IEB) integrity and its association with autophagy. Methods: A DSS-induced colitis model was used to assess the effects of miR-192-5p on intestinal inflammation. In vitro experiments involved cell culture and transient transfection techniques. Various assays, including dual-luciferase reporter gene assays, quantitative real-time PCR, western blotting, and measurements of transepithelial electrical resistance, were performed to evaluate changes in miR-192-5p expression, Rictor levels, and autophagy flux. Immunofluorescence staining, H&E staining, TEER measurements, and FITC-dextran analysis were also employed. Results: Our findings revealed a reduced expression of miR-192-5p in inflamed intestinal tissues, correlating with impaired IEB function. Overexpression of miR-192-5p alleviated TNF-induced IEB dysfunction by targeting Rictor, resulting in enhanced autophagy flux in enterocytes (ECs). Moreover, the therapeutic potential of miR-192-5p was substantiated in colitis mice, wherein increased miR-192-5p expression ameliorated intestinal inflammatory injury by enhancing autophagy flux in ECs through the modulation of Rictor. Conclusion: Our study highlights the therapeutic potential of miR-192-5p in enteritis by demonstrating its role in regulating autophagy and preserving IEB function. Targeting the miR-192-5p/Rictor axis is a promising approach for mitigating gut inflammatory injury and improving barrier integrity in enteritis patients.

The family Paenibacillaceae is linked to the order Caryophanales. Paenibacillaceae members residing in compost or soil play crucial roles in nutrient recycling and breaking down complex organic materials. However, our understanding of Paenibacillaceae remains limited.

Abstract Severe acute respiratory syndrome coronavirus-2 (SARS-CoV-2) is a serious threat to global health. One attractive antiviral target is the membrane fusion mechanism employed by the virus to gain access to the host cell. Here we report a robust protein-based fluorescent polarization assay, that mimicking the formation of the six-helix bundle (6-HB) process during the membrane fusion, for the evaluation and screening of SARS-CoV-2 fusion Inhibitors. The IC 50 of known inhibitors, HR2P, EK1, and Salvianolic acid C (Sal C) were measured to be 6 nM, 2.5 nM, and 8.9 µM respectively. In addition, we found Sal A has a slightly lower IC 50 (3.9 µM) than Sal C. Interesting, simple caffeic acid can also disrupt the formation of 6-HB with sub-mM concentration. A pilot high throughput screening (HTS) a small marine natural product library validates the assay with a Z’ factor close to 0.8. We envision the current assay provides a convenient way to screen SARS-CoV-2 fusion inhibitor and assess their binding affinity.

The efficient and accurate separation of immunoglobulin G (IgG) plays a vital role for disease diagnosis and therapy, but it is always hampered by the huge geometric size and complex structure of IgG. In this work, an amorphous Fe/Co bimetallic organic framework (denoted as PMOF-Fe/Co) is fabricated for IgG separation, with octa-carboxyl polyhedral oligomeric silsesquioxane (OCPOSS) as modulator for the first time. Benefiting from the rigid nanostructure and competitive coordination of OCPOSS, the aperture of PMOF-Fe/Co is enlarged to ∼20 nm along with the generation of enormous structural defects, which enables the accommodation of protein species with high molecular weights and large sizes. OCPOSS is also found exerting a positive impact on mediating the specific recognition and adsorption ability of PMOF-Fe/Co towards IgG through metal affinity, hydrophilic and hydrophobic interactions. Consequently, the multimode and multivalent affinity of PMOF-Fe/Co gives rise to an extraordinary adsorption capacity (2691.7 mg g

Seven previously undescribed compounds, including four diketomorpholine alkaloids (1‒4), one indole diketopiperazine alkaloid (9), one chromone (10), and one benzoic acid derivative (13), and nine known compounds (5–8, 11, 12, and 14–16) were isolated from two different fungal sources. Nine of these metabolites (1–9) were obtained from a seagrass-derived Aspergillus alabamensis SYSU-6778, while the others were obtained from a mixed culture of A. alabamensis SYSU-6778 and a co-isolated fungus A. fumigatiaffinis SYSU-6786. The chemical structures of the compounds were deduced via spectroscopic techniques (including HRESIMS, 1D and 2D NMR), chemical reactions, and ECD calculations. It is worth noting that compound 10 was identified as a defensive secondary metabolite of strain SYSU-6786, produced through the induction of compound 8 under co-culture conditions. Compounds 3 and 4 possessed a naturally rare isotryptophan core. Moreover, compounds 1 and 2 exhibited potent inhibitory activities against fish pathogenic bacterium Edwardsiella ictalurid, with minimum inhibitory concentration values of 10.0 μg/mL for both compounds.

Janus bio-adhesive hydrogels are promising for preventing postoperative tissue adhesions. However, integrating adhesive and non-adhesive interfaces entail multiple processes, posing challenges in meeting complex clinical demands. Herein, a Janus chitosan (CS) and poly (ethylene glycol) methacrylate (PEGMA) hydrogel (CS/PEG hydrogel) was developed via a one-pot phase separation polymerization process. This phase separation was driven by a simultaneous hydrogelation upon ultraviolet light irradiation on the top and heating at the bottom of the precursor solution. The light-induced surface (denoted as LIS) was rich in CS, while the heat-induced surface (denoted as HIS) contained a large amount of PEGMA. Non-adhesion HIS due to a large amount of PEG exhibited a pore size of 235.0 ± 11.3 μm, permitting mature vascularization. Adhesive LIS containing CS maximized the adhesiveness of the untreated wound, reaching 94.1 ± 3.3 J·m⁻². The three-dimensional crosslinking network ensured adequate strength to match the mechanical properties of skin with tensile modulus and compressive modulus reaching 32.2 kPa and 121.9 kPa, respectively. In vitro and in vivo experiments confirmed that this Janus hydrogel achieved nearly complete wound closure (>96%) within 14 days by promoting antibacterial activity, anti-inflammation, epithelialization, angiogenesis, and collagen deposition. The straightforward one-step integration of biocompatible CS and PEG to produce asymmetric hydrogel creates new opportunities for manufacturing adhesive dressings in advanced tissue repair scenarios.