During rest, brain activity is synchronized between different regions widely distributed throughout the brain, forming functional networks. However, the molecular mechanisms supporting functional connectivity remain undefined. We show that functional brain networks defined with resting-state functional magnetic resonance imaging can be recapitulated by using measures of correlated gene expression in a post mortem brain tissue data set. The set of 136 genes we identify is significantly enriched for ion channels. Polymorphisms in this set of genes significantly affect resting-state functional connectivity in a large sample of healthy adolescents. Expression levels of these genes are also significantly associated with axonal connectivity in the mouse. The results provide convergent, multimodal evidence that resting-state functional networks correlate with the orchestrated activity of dozens of genes linked to ion channel activity and synaptic function.

Importance The development of an alcohol use disorder in adolescence is associated with increased risk of future alcohol dependence. The differential associations of risk factors with alcohol use over the course of 8 years are important for preventive measures. Objective To determine the differential associations of risk-taking aspects of personality, social factors, brain functioning, and familial risk with hazardous alcohol use in adolescents over the course of 8 years. Design, Setting, and Participants The IMAGEN multicenter longitudinal cohort study included adolescents recruited from European schools in Germany, the UK, France, and Ireland from January 2008 to January 2019. Eligible participants included those with available neuropsychological, self-report, imaging, and genetic data at baseline. Adolescents who were ineligible for magnetic resonance imaging or had serious medical conditions were excluded. Data analysis was conducted from July 2021 to September 2022. Exposure Personality testing, psychosocial factors, brain functioning, and familial risk of alcohol misuse. Main Outcome and Measures Hazardous alcohol use as measured with the Alcohol Use Disorders Identification Test scores, a main planned outcome of the IMAGEN study. Alcohol misuse trajectories at ages 14, 16, 19, and 22 years were modeled using latent growth curve models. Results A total of 2240 adolescents (1110 female [49.6%] and 1130 male [50.4%]) were included in the study. There was a significant negative association of psychosocial resources (β = −0.29; SE = 0.03; P < .001) with the general risk of alcohol misuse as well as a significant positive association of the risk-taking aspects of personality with the intercept (β = 0.19; SE = 0.04; P < .001). Furthermore, there were significant positive associations of the social domain (β = 0.13; SE = 0.02; P < .001) and the personality domain (β = 0.07; SE = 0.02; P < .001) with trajectories of alcohol misuse development over time (slope). Family history of substance misuse was negatively associated with general risk of alcohol misuse (β = −0.04; SE = 0.02; P = .045) and its development over time (β = −0.03; SE = 0.01; P = .01). Brain functioning showed no significant association with intercept or slope of alcohol misuse in the model. Conclusions and Relevance The findings of this cohort study suggest known risk factors of adolescent drinking may contribute differentially to future alcohol misuse. This approach may inform more individualized preventive interventions.