Healthy Research Rewards
ResearchHub is incentivizing healthy research behavior. At this time, first authors of open access papers are eligible for rewards. Visit the publications tab to view your eligible publications.
Got it
KD
Kevin Dawson
Author with expertise in Genomic Landscape of Cancer and Mutational Signatures
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
12
(100% Open Access)
Cited by:
6,523
h-index:
49
/
i10-index:
69
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

The mutational landscape of normal human endometrial epithelium

Luiza Moore et al.Apr 22, 2020
All normal somatic cells are thought to acquire mutations, but understanding of the rates, patterns, causes and consequences of somatic mutations in normal cells is limited. The uterine endometrium adopts multiple physiological states over a lifetime and is lined by a gland-forming epithelium1,2. Here, using whole-genome sequencing, we show that normal human endometrial glands are clonal cell populations with total mutation burdens that increase at about 29 base substitutions per year and that are many-fold lower than those of endometrial cancers. Normal endometrial glands frequently carry ‘driver’ mutations in cancer genes, the burden of which increases with age and decreases with parity. Cell clones with drivers often originate during the first decades of life and subsequently progressively colonize the epithelial lining of the endometrium. Our results show that mutational landscapes differ markedly between normal tissues—perhaps shaped by differences in their structure and physiology—and indicate that the procession of neoplastic change that leads to endometrial cancer is initiated early in life. Whole-genome sequencing of normal human endometrial glands shows that most are clonal cell populations and frequently carry cancer driver mutations that occur early in life, and that parity has a protective effect.
0
Citation396
0
Save
4

Clonal dynamics of haematopoiesis across the human lifespan

Emily Mitchell et al.Jun 1, 2022
Abstract Age-related change in human haematopoiesis causes reduced regenerative capacity 1 , cytopenias 2 , immune dysfunction 3 and increased risk of blood cancer 4–6 , but the reason for such abrupt functional decline after 70 years of age remains unclear. Here we sequenced 3,579 genomes from single cell-derived colonies of haematopoietic cells across 10 human subjects from 0 to 81 years of age. Haematopoietic stem cells or multipotent progenitors (HSC/MPPs) accumulated a mean of 17 mutations per year after birth and lost 30 base pairs per year of telomere length. Haematopoiesis in adults less than 65 years of age was massively polyclonal, with high clonal diversity and a stable population of 20,000–200,000 HSC/MPPs contributing evenly to blood production. By contrast, haematopoiesis in individuals aged over 75 showed profoundly decreased clonal diversity. In each of the older subjects, 30–60% of haematopoiesis was accounted for by 12–18 independent clones, each contributing 1–34% of blood production. Most clones had begun their expansion before the subject was 40 years old, but only 22% had known driver mutations. Genome-wide selection analysis estimated that between 1 in 34 and 1 in 12 non-synonymous mutations were drivers, accruing at constant rates throughout life, affecting more genes than identified in blood cancers. Loss of the Y chromosome conferred selective benefits in males. Simulations of haematopoiesis, with constant stem cell population size and constant acquisition of driver mutations conferring moderate fitness benefits, entirely explained the abrupt change in clonal structure in the elderly. Rapidly decreasing clonal diversity is a universal feature of haematopoiesis in aged humans, underpinned by pervasive positive selection acting on many more genes than currently identified.
4
Citation299
1
Save
Load More