Western lifestyle is associated with high prevalence of allergy, asthma and other chronic inflammatory disorders. To explain this association, we tested the 'biodiversity hypothesis', which posits that reduced contact of children with environmental biodiversity, including environmental microbiota in natural habitats, has adverse consequences on the assembly of human commensal microbiota and its contribution to immune tolerance.We analysed four study cohorts from Finland and Estonia (n = 1044) comprising children and adolescents aged 0.5-20 years. The prevalence of atopic sensitization was assessed by measuring serum IgE specific to inhalant allergens. We calculated the proportion of five land-use types--forest, agricultural land, built areas, wetlands and water bodies--in the landscape around the homes using the CORINE2006 classification.The cover of forest and agricultural land within 2-5 km from the home was inversely and significantly associated with atopic sensitization. This relationship was observed for children 6 years of age and older. Land-use pattern explained 20% of the variation in the relative abundance of Proteobacteria on the skin of healthy individuals, supporting the hypothesis of a strong environmental effect on the commensal microbiota.The amount of green environment (forest and agricultural land) around homes was inversely associated with the risk of atopic sensitization in children. The results indicate that early-life exposure to green environments is especially important. The environmental effect may be mediated via the effect of environmental microbiota on the commensal microbiota influencing immunotolerance.

Atopic dermatitis is an inflammatory, pruritic skin disease that often occurs in early infancy with a chronic course. However, a specific description of subtypes of atopic dermatitis depending on the timing of onset and progression of the disease in childhood is lacking.To identify different phenotypes of atopic dermatitis using a definition based on symptoms before age 6 years and to determine whether some subtypes are more at risk for developing other allergic diseases.The Protection Against Allergy Study in Rural Environments (PASTURE) is a European birth cohort where pregnant women were recruited between August 2002 and March 2005 and divided in 2 groups dependent on whether they lived on a farm. Children from this cohort with data on atopic dermatitis from birth to 6 years of age were included.Atopic dermatitis, defined as an itchy rash on typical locations from birth to 6 years.The latent class analysis was used to identify subtypes of atopic dermatitis in childhood based on the course of symptoms. Multivariable logistic regressions were used to analyze the association between atopic dermatitis phenotypes and other allergic diseases.We included 1038 children; of these, 506 were girls. The latent class analysis model with the best fit to PASTURE data separated 4 phenotypes of atopic dermatitis in childhood: 2 early phenotypes with onset before age 2 years (early transient [n = 96; 9.2%] and early persistent [n = 67; 6.5%]), the late phenotype with onset at age 2 years or older (n = 50; 4.8%), and the never/infrequent phenotype (n = 825; 79.5%), defined as children with no atopic dermatitis. Children with both parents with history of allergies were 5 times more at risk to develop atopic dermatitis with an early-persistent phenotype compared with children with parents with no history of allergies. Both early phenotypes were strongly associated with food allergy. The risk of developing asthma was significantly increased among the early-persistent phenotype (adjusted odds ratio, 2.87; 95% CI, 1.31-6.31). The late phenotype was only positively associated with allergic rhinitis.Using latent class analysis, 4 phenotypes of atopic dermatitis were identified depending on the onset and course of the disease. The prevalence of asthma and food allergy by 6 years of age was strongly increased among children with early phenotypes (within age 2 years), especially with persistent symptoms. These findings are important for the development of strategies in allergy prevention.

Host and environment early-life risk factors are associated with progression of wheezing symptoms over time; however, their individual contribution is relatively small. We hypothesised that the dynamic interactions of these factors with an infant's developing respiratory system are the dominant factor for subsequent wheeze and asthma.