Inactivation of the von Hippel-Lindau protein (pVHL) has been implicated in the pathogenesis of renal carcinomas and central nervous system hemangioblastomas. These are highly vascular tumors which overproduce angiogenic peptides such as vascular endothelial growth factor/vascular permeability factor (VEGF/VPF). Renal carcinoma cells lacking wild-type pVHL were found to produce mRNAs encoding VEGF/VPF, the glucose transporter GLUT1, and the platelet-derived growth factor B chain under both normoxic and hypoxic conditions. Reintroduction of wild-type, but not mutant, pVHL into these cells specifically inhibited the production of these mRNAs under normoxic conditions, thus restoring their previously described hypoxia-inducible profile. Thus, pVHL appears to play a critical role in the transduction of signals generated by changes in ambient oxygen tension.

Like in other eukaryotic organisms, mitogen-activated protein (MAP) kinase cascades play important roles in response to host and environmental signals in fungal pathogens.In general, mitogen-activated protein kinase (MAPK) is activated by phosphorylation at the well-conserved threonine-x-tyrosine (TXY) motif by mitogen-activated protein kinase (MEK), which is in turn activated by mitogen-activated protein kinase (MEKK).The budding yeast Saccharomyces cerevisiae has five MAPK pathways that regulate mating, invasive growth, cell wall integrity, osmoregulation, and ascospore formation.Except for ascosporogenesis-specific MAPK sporulation-specific mitogen-activated protein kinase (Smk1), other yeast MAPKs are conserved in plant-pathogenic ascomycetes to regulate different infection and developmental processes, which is the focus of this review.In phytopathogenic basidiomycetes, MAPKs have only been well characterized in Ustilago maydis.

Heme is a crucial component in endowing plant-based meat analogs with flavor and color. This study aimed to develop a green strategy for heme production by reducing fermentation off-odor and accelerating heme synthesis. First, an efficient CRISPR/Cas9n system was constructed in

Abstract Current measurement technologies encompass a wide array of techniques, numbering over ten distinct methods. Among these, current sensors such as Rogowski coils and transformers based on Ampere’s law stand out. These sensors utilize electrical insulation between the primary and secondary windings, ensuring accurate and safe current measurement. In practical applications, current sensors play a critical role across various industries. They have become indispensable components in numerous devices, including inverters, DC/DC converters, motor controllers, uninterruptible power supplies, switch-mode power supplies, process control systems, and battery management systems. However, the high performance of these sensors often comes with increased costs, necessitating a thorough exploration of their notable advantages and inherent limitations. This paper aims to provide a detailed overview of the working principles and applications of various current sensors. By offering a clearer understanding of the different operating modes of these sensors and their respective strengths and limitations in practical applications, this paper seeks to furnish subsequent researchers with valuable insights for future investigations.

ABSTRACT Alternative splicing (AS) and alternative polyadenylation (APA) of pre-mRNAs contribute greatly to transcriptome complexity and gene expression regulation in higher eukaryotes. Their biological impact in filamentous fungi, however, has been poorly studied. Here we combine PacBio Isoform Sequencing and strand-specific RNA-Seq of multiple tissues together with mutant characterization to reveal the landscape, complexity and regulation of AS and APA in the filamentous plant pathogenic fungus Fusarium graminearum . We updated the reference genome and generated a comprehensive annotation comprising 51,617 transcript isoforms from 17,189 genes. Majority of the transcripts represent novel isoforms, including 2,998 undiscovered protein-coding genes. In total, 42.7% of multi-exonic genes and 64.8% of genes have AS and APA isoforms, respectively, suggesting AS and APA increase previously unrecognized transcriptome complexity in fungi. Nonsense-mediated mRNA decay factor FgUPF1 may not degrade AS transcripts with premature-stop codons but regulate ribosome biogenesis. Distal polyadenylation sites have a strong signal but proximal polyadenylation isoforms are high expressed. The core 3’-end processing factors FgRNA15, FgHRP1, and FgFIP1 play important roles in promoting proximal polyadenylation site usage and also intron splicing. Genome-wide increase in the abundance of transcripts with retained introns and long 3’-UTRs and downregulation of the spliceosomal and 3’-end processing factors are found in older tissues and quiescent conidia, indicating that intron retention and 3’-UTR lengthening may be a transcriptional signature of aging and dormancy in fungi. Overall, our study generates a comprehensive full-length transcript annotation for F. graminearum and provides new insights into the complexity and regulation of transcriptome in filamentous fungi.

Reactive oxygen species (ROS) is promising in cancer therapy by accelerating tumor cell death, whose therapeutic efficacy, however, is greatly limited by the hypoxia in the tumor microenvironment (TME) and the antioxidant defense. Amplification of oxidative stress has been successfully employed for tumor therapy, but the interactions between cancer cells and the other factors of TME usually lead to inadequate tumor treatments. To tackle this issue, we develop a pH/redox dual-responsive nanomedicine based on the remodeling of cancer-associated fibroblasts (CAFs) for multi-pronged amplification of ROS (ZnPP@FQOS). It is demonstrated that ROS generated by ZnPP@FQOS is endogenously/exogenously multiply amplified owing to the CAFs remodeling and down-regulation of anti-oxidative stress in cancer cells, ultimately achieving the efficient photodynamic therapy in a female tumor-bearing mouse model. More importantly, ZnPP@FQOS is verified to enable the stimulation of enhanced immune responses and systemic immunity. This strategy remarkably potentiates the efficacy of photodynamic-immunotherapy, thus providing a promising enlightenment for tumor therapy. The therapeutic efficacy of reactive oxygen species (ROS) for cancer therapy is limited by the hypoxia in the tumor microenvironment and the antioxidant defense. Here, the authors address these limitations by developing a tumor microenvironment-responsive hybrid nanomedicine based on cancer associated fibroblasts remodeling for multi-pronged amplification of ROS.

A-to-I mRNA editing occurs during fungal sexual reproduction with an unknown mechanism. Here, we demonstrated that the eukaryotic tRNA-specific heterodimeric deaminase FgTad2-FgTad3, not typically associated with mRNA editing, is responsible for A-to-I mRNA editing in Fusarium graminearum. This editing capacity relies on the interaction between FgTad3 and a sexual stage-specific protein called Ame1. The interaction emerged in Sordariomycetes. Key residues involved in the interaction have been identified. Expression and activity of FgTad2-FgTad3 are regulated through alternative promoters, alternative translation initiation, and post-translational modifications. FgTad2-FgTad3-Ame1 efficiently edits target mRNAs in yeasts, bacteria, and human cells, with significant implications for developing base editors in therapy and agriculture. This study reveals mechanisms, regulation, and evolution of RNA editing in fungi, emphasizing protein-protein interactions in controlling enzyme function.

ADAR-mediated A-to-I RNA editing is a well-known RNA modification mechanism in metazoans that can cause nonsynonymous changes leading to amino acid substitutions. Despite a few cases that are clearly functionally important, the biological significance of most nonsynonymous editing sites in animals remains largely unknown. Recently, genome-wide A-to-I editing was found to occur mainly in the coding regions and specifically during sexual reproduction in the wheat scab fungus Fusarium graminearum that lacks ADAR orthologs. In this study, we found that both the frequency and editing level of nonsynonymous editing is significantly higher than those of synonymous editing, suggesting that nonsynonymous editing is generally beneficial and under positive selection in F. graminearum. We also showed that nonsynonymous editing favorably targets functionally more important and more conserved genes, but at less-conserved sites, indicating that the RNA editing system is adapted to fine turn protein functions by avoiding potentially deleterious editing events. Furthermore, nonsynonymous editing in F. graminearum was found to be under codon-specific selection and most types of codon changes tend to cause amino acid substitutions with distinct physical-chemical properties and smaller molecular weights, which likely have more profound impact on protein structures and functions. In addition, we found that the most abundant synonymous editing of leucine codons is adapted to fine turn the protein expression by increasing codon usage bias. These results clearly show that A-to-I RNA editing in fungi is generally adaptive and recoding RNA editing may play an important role in sexual development in filamentous ascomycetes.