CY
Cai Yuan
Author with expertise in Calcineurin-NFAT Signaling in Transcriptional Regulation
Achievements
This user has not unlocked any achievements yet.
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
7
(29% Open Access)
Cited by:
0
h-index:
25
/
i10-index:
64
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Development of a recombinant Ang1 variant with enhanced Tie2 binding and its application to attenuate sepsis in mice

Rui Wang et al.Jan 15, 2025
The angiopoietin (Ang)–Tie axis, critical for endothelial cell function and vascular development, is a promising therapeutic target for treating vascular disorders and inflammatory conditions like sepsis. This study aimed to enhance the binding affinity of recombinant Ang1 variants to the Tie2 and explore their therapeutic potential. Structural insights from the Ang1-Tie2 complex enabled the identification of key residues within the Ang1 receptor binding domain (RBD) critical for Tie2 interaction. Molecular dynamics simulations revealed that Met 436 Arg (M436R) and Ala 451 Asp (A451D) could improve Ang1’s Tie2 binding affinity. One variant, Ang1-RBD A451D , demonstrated a 100-fold increase compared to the wild type. Cellular assays revealed that Ang1 A451D enhanced Tie2 phosphorylation, promoting endothelial cell migration and tube formation. In vivo, this variant effectively reduced inflammatory cytokines and attenuated organ damage in septic mice. These findings highlight Ang1 A451D as a promising therapeutic candidate for vascular diseases, offering notable clinical potential for mitigating sepsis-related vascular dysfunction.
0

Structural insight into the Csx1–Crn2 fusion self-limiting ribonuclease of type III CRISPR system

Danping Zhang et al.Jul 5, 2024
Abstract In the type III CRISPR system, cyclic oligoadenylate (cOA) molecules act as second messengers, activating various promiscuous ancillary nucleases that indiscriminately degrade host and viral DNA/RNA. Conversely, ring nucleases, by specifically cleaving cOA molecules, function as off-switches to protect host cells from dormancy or death, and allow viruses to counteract immune responses. The fusion protein Csx1–Crn2, combining host ribonuclease with viral ring nuclease, represents a unique self-limiting ribonuclease family. Here, we describe the structures of Csx1–Crn2 from the organism of Marinitoga sp., in both its full-length and truncated forms, as well as in complex with cA4. We show that Csx1–Crn2 operates as a homo-tetramer, a configuration crucial for preserving the structural integrity of the HEPN domain and ensuring effective ssRNA cleavage. The binding of cA4 to the CARF domain triggers significant conformational changes across the CARF, HTH, and into the HEPN domains, leading the two R-X4-6-H motifs to form a composite catalytic site. Intriguingly, an acetate ion was found to bind at this composite site by mimicking the scissile phosphate. Further molecular docking analysis reveals that the HEPN domain can accommodate a single ssRNA molecule involving both R-X4-6-H motifs, underscoring the importance of HEPN domain dimerization for its activation.
0

Effects of Mixing Ratio and Lactic Acid Bacteria Preparation on the Quality of Whole-Plant Quinoa and Whole-Plant Corn or Stevia Powder Mixed Silage

Chao He et al.Jan 3, 2025
Quinoa is the only single plant that can meet all the nutritional needs of human, and its potential for feed utilization has been continuously explored, becoming a prosperous industry for poverty alleviation. In order to further tap the feeding value of whole quinoa, develop quinoa as a feed substitute for conventional crops such as corn, and improve its comprehensive utilization rate, this experiment analyzed the silage quality and mycotoxin content of mixed silage of whole-plant quinoa (WPQ) with whole-plant corn (WPC) or stevia powder(SP) in different proportions, and further improved the silage quality of mixed silage by using two lactic acid bacteria preparations (Sila-Max and Sila-Mix). The quality, microbial population, and mycotoxin levels of quinoa and corn silage, as well as that of the mixed silage of quinoa and stevia, were evaluated using single-factor analysis of variance. The impact of various lactic acid bacteria preparations on the quality of whole-quinoa and whole-corn mixed silage was investigated through two-factor analysis of variance. WPQ and WPC were mixed at the ratio of 5:5 (QB5), 6:4 (QB6), 7:3 (QB7), 8:2 (QB8), 9:1 (QB9) and 10:0 (QB10). SP was mixed with WPQ at the supplemental levels of 0.2% (QB10S2), 0.4% (QB10S4), 0.6% (QB10S6), 0.8% (QB10S8) and 1.0% (QB10S10). After 60 days of silage, the silage indexes, the number of harmful microorganisms, and the mycotoxin levels were measured, to explore the appropriate ratio of mixed silage. The membership function analysis showed that the quality of mixed silage of WPQ with SP was better, and the optimal addition amount of SP was 0.6%. The results of Max and Mix on the quality improvement test of WPQ with WPC mixed silage showed that the two lactic acid bacteria formulations increased CP and AA content, and reduced NH3-N/TN; pH was significantly lower than the control group (p < 0.01), and LA was significantly higher than the control group (p < 0.01). The microbial count results showed that the addition of lactic acid bacteria preparation significantly reduced the number of molds and aerobic bacteria, and the effect of Mix was better than that of Max. When the mixing ratio was between QB7 and QB10, mold was not detected in the lactic-acid-bacteria preparation groups. Max and Mix significantly reduced the levels of mycotoxins, both of which were far below the range of feed safety testing, and 16S rRNA sequencing revealed that the silage microbiota varied with different mixing ratios and whether lactic acid bacteria preparations were used. Max and Mix increased the relative abundance of Firmicutes, with Mix having a more significant effect, especially in the QB6 (65.05%) and QB7 (63.61%) groups. The relative abundance of Lactobacillus was significantly higher than that of the control group (p < 0.05). The relative abundance of Enterobacteriaceae and Streptococcus were negatively and positively correlated with the addition level of quinoa, respectively. Comprehensive analysis showed that adding 0.6% SP to the WPQ and using Mix in mixed silage of WPQ and WPC with the proportion of WPQ no less than 70% had the best silage effect, and was more beneficial to animal health.